Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem50aQ9CXL1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms