Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms