Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhfpl3Q9CTN8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms