Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dis3Q9CSH3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dis3Q9CSH3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dis3Q9CSH3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dis3Q9CSH3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dis3Q9CSH3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dis3Q9CSH3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dis3Q9CSH3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms