Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd1Q9CRY7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd1Q9CRY7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms