Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRW3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CRW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms