Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms