Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms