Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms