Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ska2Q9CR46 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms