Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg12Q9CQY1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms