Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms