Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PsenenQ9CQR7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PsenenQ9CQR7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms