Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms