Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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