Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms