Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DenrQ9CQJ6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms