Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms