Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQF4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQF4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CQF4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms