Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC7

Ndufb4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb4Q9CQC7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufb4Q9CQC7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ndufb4Q9CQC7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndufb4Q9CQC7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufb4Q9CQC7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ndufb4Q9CQC7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufb4Q9CQC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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