Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpa3Q9CQ71 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpa3Q9CQ71 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms