Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Efcab2Q9CQ46 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms