Protein–RNA interactions for Protein: Q99PW4

Tp53rk, TP53-regulating kinase, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53rkQ99PW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53rkQ99PW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53rkQ99PW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms