Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhe41Q99PV5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms