Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2a1Q99PM3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms