Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scd3Q99PL7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms