Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nup155Q99P88 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup155Q99P88 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms