Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2ird2Q99NI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2ird2Q99NI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms