Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acss1Q99NB1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Acss1Q99NB1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms