Protein–RNA interactions for Protein: Q99N93

Mrpl16, 39S ribosomal protein L16, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl16Q99N93 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl16Q99N93 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl16Q99N93 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms