Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac9Q99N13 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms