Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a4dQ99N05 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ms4a4dQ99N05 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ms4a4dQ99N05 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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