Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KarsQ99MN1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms