Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gdpd3Q99LY2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gdpd3Q99LY2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.4 ms