Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp1b1Q99LU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp1b1Q99LU0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms