Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms