Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp16Q99LG0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp16Q99LG0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp16Q99LG0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms