Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RtcbQ99LF4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RtcbQ99LF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms