Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Abcf2Q99LE6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcf2Q99LE6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms