Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SptssbQ925E8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms