Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ripply3Q924S9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ripply3Q924S9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms