Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tom1l1Q923U0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tom1l1Q923U0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tom1l1Q923U0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms