Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csmd1Q923L3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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