Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3b3Q921M3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b3Q921M3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b3Q921M3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms