Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HlcsQ920N2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HlcsQ920N2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HlcsQ920N2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms