Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc1bQ920F6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms