Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx18Q91ZR2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms