Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slc5a4bQ91ZP4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc5a4bQ91ZP4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc5a4bQ91ZP4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms