Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ5

Pcdhb5, Protocadherin beta 5, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb5Q91XZ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdhb5Q91XZ5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhb5Q91XZ5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb5Q91XZ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhb5Q91XZ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms