Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Basp1Q91XV3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Basp1Q91XV3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms